يختص قسم المنظمات والتعاون الدولي بالآتي:
- العمل على تعزيز العلاقات الخارجية للهيئة مع نظيراتها في الدول الأخرى في مختلف المجالات ذات الصلة بقطاع الطيران المدني.
- القيام بكافة الأنشطة المتعلقة بالتعاون الدولي، ومتابعة مختلف البرامج في هذا المجال مع الدول والمنظمات والهيئات العربية والإقليمية والدولية بالتنسيق مع الجهات المعنية.
- التنسيق مع التقسيمات الإدارية المعنية فيما يتعلق بالمؤتمرات والندوات واللجان التي تشارك فيها الهيئة.
- إحالة الدراسات والمواضيع التي ترد من المنظمات والهيئات العربية والدولية إلى جهات الاختصاص لاتخاذ ما يلزم بشأنه، ومتابعة تنفيذها.
- المشاركة في إعداد ومراجعة الاتفاقيات ودراسة مختلف مجالات التعاون مع المنظمات والهيئات العربية والإقليمية والدولية بالتنسيق مع التقسيمات الإدارية المعنية بالهيئة.
- إعداد التقارير الخاصة بأنشطة المنظمات والهيئات العربية والإقليمية والدولية التي تشارك فيها الهيئة.
- اقتراح السبل الممكنة للاستفادة من البرامج والفعاليات التي تنظمها المنظمات والهيئات العربية والإقليمية والدولية بالتنسيق مع مختلف التقسيمات الإدارية بالهيئة.
- متابعة وتنسيق إعداد المواضيع لممثلي الهيئة والمشاركين في الاجتماعات الخارجية، ومتابعة الحصول على المحاضر وتنفيذ توصياتها.
- المشاركة في إعداد مذكرات التفاهم والتعاون ودراستها، وإعداد البرامج التنفيذية لها لضمان تنفيذ البنود الواردة بها، بالتنسيق مع التقسيمات الإدارية المختصة.
- إعداد ملفات المشاركات والزيارات التي يقوم بها الرئيس التنفيذي ومديرو العموم.
- إجراء تقويم سنوي لما يتم تحقيقه في إطار التعاون الدولي وتحديد أي معوقات واقتراح الحلول المناسبة لها.
- إدارة المكتبة الفنية للهيئة وضمان تحديث الوثائق والتشريعات والنشرات الدورية وفق متطلبات المنظمات الدولية وتوزيعها على التقسيمات الإدارية المعنية.
- أي مهام أخرى تدخل ضمن نطاق اختصاصه.